眼皮里面长了一个小肉球似的东西疼可能是睑腺炎、脂肪瘤、翼状胬肉、睑板腺囊肿、皮脂腺囊肿等原因引起的，建议及时对因治疗。
1、睑腺炎：当眼睑受到病原菌入侵形成炎症反应后，在炎症刺激下，可能会造成眼内组织肿胀或增生，形成肉球状物质，同时还会伴随疼痛、有异物感等不适。可在医生指导下局部滴入左氧氟沙星滴眼液、妥布霉素滴眼液、红霉素眼膏等药物抗菌消炎。必要时还可到医院由专业医生通过手术进行排脓缓解不适。
2、脂肪瘤
是成熟脂肪在局部过度堆积引起的疾病，发生于眼部，同时体积比较大会造成病灶组织蔓延至眼内，使眼皮里面出现球状增生组织，可能会影响视力。可以通过手术切除预防复发和恶变。
3、翼状胬肉
当眼部长期受风沙或日光、炎症刺激后，结膜表面容易出现的肉状物体，形成翼状胬肉，常见伴随症状有瘙痒、视物不清等。可由专业医生通过手术将翼状胬肉切除，改善症状。
4、睑板腺囊肿
睑板腺分泌旺盛时，多余的分泌物聚积在睑板腺内形成慢性无菌性炎症，会诱发睑板腺囊肿，形成肿物，同时伴随瘙痒、分泌物增多等现象。如果囊肿较小，可通过热敷促进消退。如果囊肿较大，可到医院通过手术将囊肿切开刮除引流，彻底清除囊肿，改善症状。
5、眼眶皮样囊肿
是汗腺囊肿、脂肪粒等疾病长时间没有得到有效抑制持续发展造成。发生炎症感染后，会对周围组织产生刺激，出现较多增生组织、疼痛等不适。及时采取手术去除病灶，有助于症状改善。
眼部为人体重要器官，出现异常，需要到医院完善相关检查，以及在医生指导下采取治疗措施。